友達関係について

現在大学1年生なのですが、高校からの友達との関係で悩んでいます。

その友達とは1年の時同じクラスで、その時はとてもいい子だし、性格が合わないとは思っていませんでした。

ですが、3年生でまた同じクラスになって、仲良くしようと思って、よく喋っていたのですが、3年生の夏くらいから話している途中に、え？みたいなことを何回か言うようになってきて……その、え？もちょっと嫌な感じのえ？で、なんでそんなことをいうんだろう……と思っていたのですが、私もそこまで変なことを言ってる訳じゃなくて、分からなかったら何で？って聞いてくれたらいいのになと思いました。
それが何回か続きました。
補足ですが、その子はとてもコミュ力が高くて、誰とでもテンションを合わせることができるみたいなことを言っていて、確かに、その子の悪口をいってる人はいないし、みんなから人気があると思います。ですが、そういうことなので、私にだけそのような態度をとっているんじゃないかと思って心配していました。それに、その子は周りからの人気が高いので、その子のことを相談しても、私が悪いと言われてしまいそうで怖いので、その子と関わっている子とかに相談できません。

わたしは、え？とか何回も言われると、言いたいことが言えなくなってしまいます。

そして、その子と同じ大学になってしまって、でも、距離が近かったのかなと思い、大学では違う学部なので、距離が少し離れたら少しは関係も改善するのかなと思いましたが、一昨日会った時にもなんか、え？みたいなことを何回か言われたし、凄く気を使っていたし、なんか凄くモヤモヤして、とても疲れてしまいました。

その子との関係性をどうしたらいいか分からないですし、とてもモヤモヤしています。それに、同じ大学で高校の時仲良かった子はその子だけなので、どうしよう…と思ってしまいます。
長文になりすみません…。